在大牛的文章中,经常会看到一些展示实验流程、基因相互作用模型、信号通路等的示意图,比如下面的。
(微生物学前沿,2015)
(自然协议,2013)
(自然,2016)
在上一篇文章中,我已经介绍了使用几何图形来绘制原理图。 可能有的童鞋会问,要展示神经细胞、细胞器、核酸链、小鼠等复杂图形怎么办? 是否一定要精通Ai(Illustrator)、cdr(CorelDRAW)等平面设计软件?
这里推荐一个软件ChemDraw,它是一款绘制化学结构式的软件,还可以绘制3D分子模型(如下图所示)。 我在之前的文章中提到过。 它的“主要业务”是绘制各种结构式,我们这里只使用它的高质量矢量图形模板。
下面演示如何绘制上例中的部分图形。 首先通过View菜单显示Biopolymer和BioDraw这两个工具栏,如下图。
可以使用Biopolymer工具绘制核酸和蛋白质序列,如下图所示。
而BioDraw可以绘制一些生物成分,比如双螺旋、抗体、跨膜结构、细胞膜等画示意图的软件,如下图所示。 长按带有黑色三角的图标可以显示更多同类型的组件。
每个组件都可以旋转、缩放和重新着色,如下图所示。
绘制图表的另一种方法是使用模板。 按住“图章”按钮,你会看到非常丰富的图形和化学结构式模板,如下图所示。 有了这些图形,基本上就可以快速绘制出上面第一个例子中的图形组件了。
当然,你也可以通过FileSave As(如下图所示)将图形元件另存为svg和eps格式的矢量图,在Ai软件中绘制更复杂的原理图。
软件下载地址(可以试用半个月): ,软件还是很贵的,可以通过这个网站()查看它的价格,贵的东西一般都是好东西!
但如果你只是想画一幅画,半个月的试用时间就足够了; 如果你想继续使用它,我建议你使用在线版的ChemDraw。
工具网址:
该工具的界面比较简洁,因为是在线版,所以模板更新比较及时,看起来比本地版丰富一些画示意图的软件,如下图。
网络版的使用方法与本地版软件基本相同,只是保存图片的方法比较特殊,这里介绍一下。 这里我简单的画了一个注射器和一个鼠标(做了一个组合),然后点击Structure菜单下的Get SVG,如下图。
在弹出的窗口中,用CTRL+A全选所有代码,然后复制粘贴到文本编辑器(如记事本、记事本等)中,保存为“*.svg”文件。
SVG格式的矢量图可以用Ai、cdr等软件打开(如下图所示),进一步编辑,如放大缩小、颜色调整等。
今天的内容就这些了,ChemDraw很强大,一起来一探究竟吧~
参考
Song C, Zhang S, Huang H. 选择合适的微生物基因组复制起点鉴定方法[J]。 微生物学前沿,2015 年,6:1049。
Ran FA、Hsu PD、Wright J 等。 基于 CRISPR-Cas9 系统的基因组工程[J]. 自然协议,2013 年,8(11):2281-2308。
Kranz LM、Diken M、Haas H 等。 系统性 RNA 递送至树突状细胞利用抗病毒防御进行癌症免疫治疗[J]。 自然,2016,534(7607):396-401。