通过上一期，我们学习了如何通过GEO2R分析GEO数据，得到最终的差异表达基因。
这一次，我将为您提供可以用来制作维恩图的工具。
继续阅读文献图片重叠，我们发现作者对三款卵巢癌相关芯片进行了分析，通过交集得到三款芯片中存在差异的基因，以供进一步分析。
在文献中，作者用一个图形来表示三个芯片的交集。 该图称为维恩图。
文氏图最大的优点是可以清晰地表达多个集合中数据之间的重叠关系。
如何制作维恩图？
经过差异基因的芯片分析和筛选，可以整理出这样一张表，利用这张表可以画出维恩图。
计算并绘制自定义维恩图
()，是一款在线维恩图绘制工具。
本网站可用于上传或复制文件以绘制维恩图。 我们通过复制粘贴上传文件。
复制粘贴差异基因，修改集合名称，点击提交得到结果。
然后我们来到一个这样的界面。 通过这个接口图片重叠，我们可以下载最终的文氏图。
如果我们还想知道中间重叠的基因部分是什么，只需单击保存文本即可。 打开 excel 表以获取每组中的所有基因。
刚才介绍的网站虽然可以得到维恩图，但是维恩图的圆圈不会根据数量动态变化。 下面介绍一个可以根据数据集大小动态变化的维恩图制作工具：
-BioVenn
()
基本操作界面与上一个类似。 我们可以选择导入文件，也可以选择直接粘贴数据。
单击“嵌入的 SVG”/“嵌入的 png”以显示维恩图。 由于 svg 可以微调结果，我们选择“嵌入式 SVG”。
结果展示是这样的，可以通过鼠标拖动来移动数据集的名称。
通过下面的统计我们可以发现维恩图的结果。 如果我们要得到三者重合的结果。 单击下方 XYZ 重叠后面的数字以显示。
对于维恩图，通常不超过五组。 Not 然后特别影响可视化。 至于超过5个合集怎么办，有需要的同学可以搜索打乱剧情。
本期我们根据文章的结果，完成了第一部分的数据选取和维恩图的制作。
《科研数据处理与论文绘图教程》
admin