亲弟弟胤禵与雍正关系不佳，是因为二人虽为一母所生，但是并非一母所养。
雍正与十四阿哥胤禵的生母都是孝恭仁皇后乌雅氏，也就是康熙朝时期的德妃。
乌雅氏在康熙十七年（1678年）生皇四子胤禛，康熙十八年（1679年）晋封为德嫔，康熙二十年（1681年）晋封为德妃，康熙二十七年（1688年）生皇十四子胤禵。
雍正出生时，德妃还没有被册封，直到雍正两岁的时候，才被册封为德嫔。所以按照当时清朝后宫的规矩，生育皇嗣但是没有受到册封的妃嫔，是没有资格抚养自己的孩子的，因而康熙下旨，将雍正安排给当时还是贵妃的孝懿仁皇后佟佳氏抚养。
德妃生十四阿哥胤禵的时候，已经是位列四妃，地位和名分已经与生雍正之时不可同日而语，因而是有资格抚养自己的孩子的，所以十四阿哥从小就是被自己亲妈抚养长大，乌雅氏也是更喜欢自己的这个小儿子。
而也正因为这兄弟二人，不是由同一任抚养十四阿哥胤禵，从小不是在一起长大的，生长的环境、接受的教育、相处的玩伴完全不同，再加上“九子夺嫡”，两人分属不同的阵营。所以虽然是同父同母，但是关系却势如水火。
雍正与十三爷，最初是因为同有寄养在其他妃子那里的经历，而惺惺相惜。
十三爷胤祥，生育康熙二十五年（1686年），生母敬敏皇贵妃章佳氏。由于章佳氏在康熙三十八年（1699年）去世，十三爷胤祥也被康熙安排，有雍正皇帝的生母，德妃乌雅氏抚养。
正是这段寄养的经历，让雍正和十三爷变为了惺惺相惜的兄弟，一方面，雍正对于这个寄养在自己母亲这里，比自己小8岁的弟弟关爱有加，另一方面，两人在童年时期都被寄养在其他妃子那里，不是由母亲抚养长大的经历让他们产生了共鸣，因而雍正和十三爷自小关系就非常的要好，并且，在“九子夺嫡”的过程中，十三爷自始至终，都是坚定的站在雍正这一边。
如果没有十三爷的牺牲，雍正早就从“九子夺嫡”中出局了，甚至可以说，雍正的皇位在一定程度上是十三爷让给他的。
自康熙三十七年（1698年）十四阿哥胤禵，12岁的胤祥第一次跟随康熙去盛京谒陵，直至康熙四十七年（1708年）整整10年间，康熙帝只要离开京师，无论去哪里，都会把十三爷胤祥带在身边，足可见康熙对于十三爷胤祥的喜爱。 但是因为康熙两废太子的事情，突然失去了康熙的宠爱。
正史中的十三爷并不像《雍正王朝》中的那样，是太子党的一员，相反，他也是反太子集团的一员，在康熙两废皇太子的过程中，十三爷胤祥都积极参与其中。而当时的康熙，非常反感皇子反对太子，觊觎皇位的行为，因而在知晓十三爷也在串通串联，企图推翻太子后，大为恼火，但是康熙并不认为这是十三爷自己的所为，而是背后有人指使，他让十三爷胤祥一再交代谁后幕后指使之人，而十三爷就是闭口不谈，因而盛怒之下的康熙不仅疏远了十三爷，而且还将其进行圈禁。
十三爷所要保护的人，正是雍正，也正是因为十三爷的保护，让雍正顺利度过两废皇太子的危机，赢得了康熙的信任，并且最终夺得了皇位。如果那个时候，十三爷说出了雍正，那么按照当时的情况，十三爷继位的可能性也将变得极大。
雍正登基后，对于十三爷和十四阿哥可谓是天壤之别。
由于十三爷对于雍正能够成功夺取皇位做出了巨大的自我牺牲，加上二人从小亲密无间的感情，雍正一继位就册封十三爷为和硕怡亲王，总理朝政事务，同时，还将十三爷的生母章佳氏册封为敬敏皇贵妃，棺椁抬出来按照皇贵妃的标准重新葬入康熙的景陵地宫。而十三爷也是“鞠躬尽瘁死而后已”，做出的贡献远远超过了《雍正王朝》中所讲述的，雍正与十三爷胤祥，也成为一代君臣兄弟的典范。
但是对于十四阿哥，雍正则是完全另一种方式的对待，在夺了十四阿哥兵权的同时，发配十四阿哥前去看守皇陵，雍正四年（1725年）改为圈禁，直到乾隆登基后，十四阿哥胤禵才重新获得了自由。
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